Deletions_TETs_WTs

Analysis of noncoding RNA processing phenotypes in mutant yeast strains, with isogenic wildtype strains as controls two-color microarrays, total RNA labeled directly with Alexa Ulysis 546 and 648 dyes, dye-swap, eight replicates of each oligo per slide, Lowess smoother, Hedge et al. 2002 protocols, see Peng, Robinson et al., 2003.本研究针对突变酵母菌株中的非编码RNA（noncoding RNA）加工表型开展分析，以同基因野生型菌株作为对照。实验采用双色微阵列（two-color microarrays）技术，将总RNA（total RNA）直接以Alexa Ulysis 546与648染料进行标记，并设置染料互换（dye-swap）实验组；每张玻片上的每个寡核苷酸（oligo）均设置8次重复，采用Lowess平滑器（Lowess smoother）进行数据处理，实验流程遵循Hedge等人2002年的实验方案，详细内容参见Peng、Robinson等人2003年的相关研究。