胰腺导管腺癌单细胞转录组测序揭示肿瘤异质性和促进癌症发生的恶性细胞
收藏干细胞与再生医学数据中心2023-05-04 更新2024-03-06 收录
下载链接:
http://data.iscr.ac.cn/Article?id=64531e63f45ac97dd8ad18db
下载链接
链接失效反馈官方服务:
资源简介:
胰腺导管腺癌(PDAC)是最常见的胰腺癌症类型,其肿瘤内异质性高,预后差。为了全面描述PDAC肿瘤内的异质性和PDAC进展的潜在机制,我们使用单细胞RNA-seq(scRNA-seq)从原发性PDAC肿瘤和对照胰腺中获得57530个个体胰腺细胞的转录组图谱,并鉴定了不同的恶性和间质细胞类型,包括分别具有异常和恶性基因表达谱的两种导管亚型。我们发现异质性恶性亚型由几个具有不同增殖和迁移潜力的亚群组成。细胞轨迹分析显示,多种肿瘤相关途径和转录因子(TF)的成分在PDAC进展过程中差异表达。此外,我们发现具有独特增殖特征的导管细胞亚群与肿瘤浸润性T细胞的失活状态有关,为预测抗肿瘤免疫反应提供了新的标志物。总之,我们的发现为破译PDAC的肿瘤内异质性提供了宝贵的资源,并揭示了肿瘤内在转录状态和T细胞活化之间的联系,为靶向治疗和免疫治疗等抗癌治疗提供了潜在的生物标志物。
提供机构:
中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
创建时间:
2023-05-04



