Data S1 - Nanostring

Innate immune transcriptional signature during the time course of SARS-COV-2 infection in Human Airway Epithelia (MOI 0.1 24, 48 72hpi).
After on-column mRNA extraction, gene expression levels were evaluated using two customized NanoString nCounter Gene Expression Panels: “immune response” (96 genes) and “type III IFNs” (12 genes). Data processing and normalization were performed with nSolver analysis software (version 4.0, NanoString technologies) and results are expressed in fold change induction compared to the mock condition. Heatmap and Principal Component Analysis (PCA) were produced using Genomics Suite 7 (Partek, St Louis, MO, USA).
After on-columns mRNA extraction, expression was evaluated using two different gene panels (composed of 96 and 12 genes respectively) using the Nanostring technology. Data treatment and normalization ware performed with nSolver analysis software (version 4.0, NanoString technologies). Results are expressed in counts and fold change induction compared to the mock condition.

在人类气道上皮细胞中，SARS-CoV-2感染时间进程中的先天免疫转录特征（MOI 0.1，24、48、72小时PI）。在柱上mRNA提取后，利用两种定制的NanoString nCounter基因表达阵列对基因表达水平进行评估：'免疫反应'（包含96个基因）和'type III IFNs'（包含12个基因）。数据处理和标准化采用nSolver分析软件（版本4.0，NanoString technologies）进行，结果以与模拟条件相比的倍数变化诱导表达。热图和主成分分析（PCA）由Genomics Suite 7（Partek，圣路易斯，密苏里州，美国）生成。
在柱上mRNA提取后，使用两种不同的基因阵列（分别由96和12个基因组成）通过Nanostring技术评估表达。数据处理和标准化使用nSolver分析软件（版本4.0，NanoString technologies）执行。结果以计数和与模拟条件相比的倍数变化诱导表达表示。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集基于NanoString技术，研究了SARS-CoV-2感染人类气道上皮细胞的时间过程（MOI 0.1，24、48、72小时感染后），重点关注先天免疫转录特征。它使用两个定制化基因表达面板（共108个基因），通过nSolver软件处理数据，结果以倍数变化表示，并包括热图和PCA分析，旨在揭示感染期间的基因表达动态。