Sub-telomeric repeat expansion in <i>Hydractinia symbiolongicarpus</i> chromosomes

This repository contains the files used for the analysis of <b>repetitive elements accumulated in the subtelomeric regions</b> of <i>Hydractinia symbiolongicarpus</i>.<b>TERT_Human_ NP_937983.2.fasta:</b> Human TERT protein sequence.<b>TERT_Hydactinia_XP_057313859.1.fasta</b>: Hydractinia TERT protein sequence.<b>TERT_Nematostella_XP_032223148.2.fasta</b>: Nematostella TERT protein seqeuence.<b>HSymV2.0.fasta</b>: <i>Hydractinia symbiolongicarpus</i> genome sequence.<b>HSymV2.0.gtf</b>: <i>Hydractinia symbiolongicarpus</i> genome annotation.<b>HSymHel.fasta</b>: Consensus sequence of HSymHel.<b>HSymIS3EUlR.fasta</b>: Consensus sequence of HSymIS3EUlR.<b>HSymSHlR.fasta</b>: Consensus sequence of HSymSHlR.<b>HSymSR.fasta</b>: Consensus sequence of HSymSR.<b>NveSHlR.fasta</b>: Consensus sequence of NveSHlR.<br><br><br><br><br>本存储库包含用于分析**共生水螅（*Hydractinia symbiolongicarpus*）**亚端粒区域累积重复元件的相关文件。**TERT_Human_ NP_937983.2.fasta：**人类TERT蛋白序列。**TERT_Hydractinia_XP_057313859.1.fasta：**共生水螅（*Hydractinia symbiolongicarpus*）TERT蛋白序列。**TERT_Nematostella_XP_032223148.2.fasta：**海葵（*Nematostella*）TERT蛋白序列。**HSymV2.0.fasta：**共生水螅（*Hydractinia symbiolongicarpus*）基因组序列。**HSymV2.0.gtf：**共生水螅（*Hydractinia symbiolongicarpus*）基因组注释文件。**HSymHel.fasta：**HSymHel的共识序列。**HSymIS3EUlR.fasta：**HSymIS3EUlR的共识序列。**HSymSHlR.fasta：**HSymSHlR的共识序列。**HSymSR.fasta：**HSymSR的共识序列。**NveSHlR.fasta：**NveSHlR的共识序列。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集提供了关于'Hydractinia symbiolongicarpus'（一种海洋水螅体）染色体亚端粒区域重复序列扩展的研究数据。它包含该物种的基因组序列、注释文件以及多种转座元件（如Helitrons）的共有序列，用于分析亚端粒重复元件的积累和进化。数据集还涵盖了人类和相关物种的TERT蛋白序列，以支持比较基因组学研究。