OmniPath

OmniPath is a database combining diverse molecular knowledge from 168 resources. It covers causal protein-protein, gene regulatory, miRNA, and enzyme-PTM (post-translational modification) interactions, cell-cell communication, protein complexes, and information about the function, localization, structure, and many other aspects of biomolecules. It prioritizes literature curated data, and complements it with predictions and large scale databases.

OmniPath是一款整合了168个来源的多样化分子知识的数据库。该数据库涵盖因果性蛋白质-蛋白质相互作用、基因调控相互作用、微小RNA（miRNA）相互作用、酶-翻译后修饰（post-translational modification，PTM）相互作用、细胞通讯、蛋白质复合物，以及生物分子的功能、定位、结构等多方面信息。其优先采用经文献人工审校的数据，并通过预测模型与大规模数据库对其进行补充完善。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

OmniPath是一个综合性的分子生物学数据库，整合了超过100个资源的数据，涵盖蛋白质相互作用、基因调控、酶-PTM关系等多个领域。它提供了多种工具和接口（如R、Python和Cytoscape插件），方便用户进行数据查询和网络构建。