Cistrome Data Browser

Cistrome Data Browser v3.0 is a resource for ChIP-seq, ATAC-seq, and DNase-seq data from humans and mice, providing maps of genome-wide locations of transcription factors, cofactors, chromatin remodelers, histone modifications, and accessible chromatin regions. It contains approximately 45,000 human and 44,000 mouse samples, with 32,000 new datasets added.

Cistrome 数据浏览器v3.0是一款面向人类与小鼠的ChIP-seq（染色质免疫共沉淀测序）、ATAC-seq（转座酶可及性测序）以及DNase-seq（DNase I超敏位点测序）数据的专业数据库资源，可提供全基因组范围内转录因子、辅因子、染色质重塑因子、组蛋白修饰及染色质开放区域的定位图谱。该数据库共收录约4.5万个人类样本与4.4万个小鼠样本，其中新增数据集3.2万个。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

Cistrome Data Browser 是一个专注于人类基因组ChIP-seq数据的在线浏览平台，基于hg38参考基因组构建。它支持通过转录因子、细胞类型、靶基因和基因组区域等多种方式进行数据搜索，旨在帮助研究人员探索蛋白质-DNA相互作用和调控元件。数据集提供了广泛的染色体和基因组坐标信息，是一个综合性的基因组学资源。