肌萎缩侧索硬化患者遗传学及生物标志物的研究

【研究目的】：DNAJC7基因是2020年新发现的肌萎缩侧索硬化(ALS)的致病基因，本研究旨在探讨DNAJC7基因在中国ALS患者中的突变率及临床特点，优化中国ALS患者突变基因筛查的决策。
【研究方法】：入组了2017．8．2019．7就诊于北京协和医院神经科诊断为肯定ALS，拟诊ALS和实验室支持的ALS患者326例，其中散发ALS患者304例，家族ALS患者16例，ALS合并额颞叶痴呆6例，此外，2445名同种族健康对照者也纳入了本研究，用于分析健康人DNAJC7基因的突变率。采用全外显子检测技术(Whole Exome Sequencing，WES)进行基因分析，并使用PCR技术验证WES中发现的变异位点。我们使用gnomeAD及ExAC数据库分析健康人的变异频率，使用PolyPhen2，MutationTaster和SIFT软件预测错义突变的致病性，使用Phylop软件评估变异位点的保守性。我们依据美国遗传学和基因组学会2015年颁布的临床基因检测结果分析指南ACMG准则对每个突变位点进行致病性评级。
【研究结果】：经过测序比对，发现DNAJC7基因的2处罕见杂合变异。一名球部起病患者DNAJC7基因的5号外显子上存在一处杂合错义变异c．410A>G，P．K137R，该突变位点在gnomeAD，ExAC数据库以及本地数据库中均不存在，且在哺乳动物中高度保守，MutationTaster，SIFT，Polyphen2软件预测结果分别为致病性，耐受性，及良性变异，P．K137R变异会改变DNAJC7蛋白TPR基序的a螺旋结构，依据ACMG指南标准为临床意义未明的变异(uncertain significantvariant，VUS)。还有5名患者DNAJC7基因ll号外显子上存在一处杂合错义突变，c．1106A>C，P．N369T。该位点在ExAC数据库中的变异频率为0．016％，ExAC数据库中的变异频率为0．029％，本地数据库中的突变频率为0．65％，MutationTaster，SIFT，Polyphen2软件预测结果分别为致病性，耐受性，及良性，依据ACMG指南标准，为VUS。这6例患者均未合并其他己知的致病突变。
【研究结论】：DNAJC7基因不是我国ALS患者中的常见致病基因。我国ALS遗传背景及突变谱系与欧美人群存在较大差异。