Yeast database

Yeast 6 comprises 1458 metabolites participating in 1888 reactions, which are annotated with 900 yeast genes encoding the catalyzing enzymes. Compared with Yeast 5, Yeast 6 demonstrates improved sensitivity, specificity and positive and negative predictive values for predicting gene essentiality in glucose-limited aerobic conditions when analyzed with flux balance analysis.酵母6号（Yeast 6）包含1458种代谢物，参与1888个反应，这些反应由900个编码催化酶的酵母基因进行注释。相较于酵母5号（Yeast 5），在葡萄糖限制有氧条件下采用通量平衡分析（flux balance analysis）进行分析时，酵母6号在预测基因必需性方面的灵敏度、特异性以及阳性、阴性预测值均得到了提升。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集为酵母数据库，包含1458种代谢物和1888个反应，并关联900个酵母基因用于酶催化注释。与前一版本相比，在特定条件下进行通量平衡分析时，其预测基因必需性的性能得到提升。