去甲基化酶NMAD-1A亚型蛋白的X-射线成像数据集

"NMAD-1A与人ALKBH4的序列同源性最高，达32.7%。研究人员发现体外纯化的NMAD-1蛋白的两个亚型（NMAD-1A和NMAD-1B）都能将6mA和3mC标记的寡聚核苷酸去甲基化，但不能去甲基化1mA标记的寡聚核苷酸，体内和体外的实验结果说明NMAD-1主要是线虫的一个DNA 6mA。对于组蛋白H3K4me2去甲基化酶spr-5缺失的线虫，当nmad-1基因敲除后，随着传代次数的增加，线虫逐渐表现出生育缺陷，直至生育能力丧失。虽然线虫的 NMAD-1蛋白也属于 AlkB蛋白家族，但它与结构已知蛋白之间的序列同源性均低于 15 %，这说明 NMAD-1在三维结构上具有其自身的特征。除此之外，NMAD-1在功能上还有很多特点区别于家族中的其他成员，如可能存在一个锌指结构等等。
本数据集描写的是去甲基化酶NMAD-1A亚型蛋白的X-射线衍射数据，蛋白质原子三维坐标文件和蛋白质电子密度图。分别是野生型和突变体结合离子SO42-、不同配体Mn2+、Mn2+和α-KG的结构。"

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集聚焦于去甲基化酶NMAD-1A亚型蛋白，它属于AlkB蛋白家族，具有独特的DNA 6mA去甲基化功能。数据集提供了该蛋白的X-射线衍射数据，包括野生型和突变体结合不同配体的三维坐标和电子密度图。