GutBugDB

GutBugDB is an open-access repository that combines 363 k gut-bacterial metabolic enzymes (from ≈ 700 genomes) with machine-learning and similarity-search predictions to chart potential microbiome-mediated biotransformations of 1 400 + FDA-approved drugs and nutraceuticals, allowing query by drug class, bacterial taxonomy and enzyme EC number.GutBugDB 是一款开放获取资源库，其整合了源自约700个细菌基因组的36.3万种肠道细菌代谢酶，并结合机器学习与相似性搜索预测结果，用以描绘1400余种经美国食品药品监督管理局（Food and Drug Administration，FDA）批准的药物及营养保健品的潜在微生物组介导生物转化路径，同时支持按药物类别、细菌分类学以及酶学委员会（Enzyme Commission，EC）编号进行检索。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

GutBugDB是一个开放访问的存储库，整合了来自约700个基因组的363k肠道细菌代谢酶，并利用机器学习和相似性搜索预测来绘制1400多种FDA批准药物和营养品的潜在微生物介导生物转化。该资源支持按药物类别、细菌分类和酶EC号进行查询，旨在预测人类肠道微生物介导的生物转化过程。