TNBC Data from Wu et al, 2021

Anndata format of the TNBC data set generated by Wu et al, 2021, together with inferred cytokine activity, as described in Dimitrov et al, 2022.<br> <br> <br> Wu, S.Z., Al-Eryani, G., Roden, D.L., Junankar, S., Harvey, K., Andersson, A., Thennavan, A., Wang, C., Torpy, J.R., Bartonicek, N. and Wang, T., 2021. A single-cell and spatially resolved atlas of human breast cancers. <em>Nature genetics</em>, <em>53</em>(9), pp.1334-1347.<br> <br> Dimitrov, D., Türei, D., Garrido-Rodriguez, M., Burmedi, P.L., Nagai, J.S., Boys, C., Ramirez Flores, R.O., Kim, H., Szalai, B., Costa, I.G. and Valdeolivas, A., 2022. Comparison of methods and resources for cell-cell communication inference from single-cell RNA-Seq data. <em>Nature Communications</em>, <em>13</em>(1), pp.1-13.

本数据集包含Wu等人2021年生成的三阴性乳腺癌（TNBC）数据集的Anndata格式文件，以及经Dimitrov等人2022年研究中所述方法推断得到的细胞因子活性数据。<br><br><br>Wu, S.Z., Al-Eryani, G., Roden, D.L., Junankar, S., Harvey, K., Andersson, A., Thennavan, A., Wang, C., Torpy, J.R., Bartonicek, N. 及 Wang, T., 2021. 人类乳腺癌的单细胞与空间分辨图谱. 《自然·遗传学》(*Nature Genetics*), 第53卷第9期, 第1334-1347页.<br><br>Dimitrov, D., Türei, D., Garrido-Rodriguez, M., Burmedi, P.L., Nagai, J.S., Boys, C., Ramirez Flores, R.O., Kim, H., Szalai, B., Costa, I.G. 及 Valdeolivas, A., 2022. 单细胞RNA测序数据的细胞间通信推断方法与资源比较. 《自然·通讯》(*Nature Communications*), 第13卷第1期, 第1-13页.

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集为Wu et al, 2021研究中的TNBC数据，以Anndata格式存储，包含推断的细胞因子活性信息。数据集与单细胞RNA-Seq数据分析相关，适用于生物信息学和计算生物学研究。