tcbb2014

tcbb2014数据集收集自DrugBank，KEGG Drug，DCDB和Matador，包括315种药物，250种靶标，5种药物之间的相似性类别和3种靶标之间的相似性类别。药物之间的相似性包括在化学，配体，性能，副作用和注释方面的相似性。靶标之间的相似性包括序列，蛋白质-蛋白质相互作用网络和基因本体相似性。该数据集的原始任务是根据网络中不同类型的相似性来预测药物与靶标之间的新型相互作用The tcbb2014 dataset is curated from DrugBank, KEGG Drug, DCDB and Matador, encompassing 315 drugs, 250 protein targets, 5 categories of drug similarities and 3 categories of target similarities. Drug similarities cover the similarity metrics in chemistry, ligands, properties, side effects and annotations. Target similarities include sequence similarity, protein-protein interaction network similarity and gene ontology similarity. The original task of this dataset is to predict novel drug-target interactions based on different types of similarity within the network.

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

tcbb2014数据集源自DrugBank、KEGG Drug、DCDB和Matador，涵盖315种药物和250种靶标，并包含药物间的化学、配体等五种相似性类别以及靶标间的序列、蛋白质相互作用等三种相似性类别。该数据集旨在基于这些相似性预测药物与靶标的新型相互作用，由马里兰大学于2014年发布。