T1-weighted in vivo human whole brain MRI dataset with an ultrahigh isotropic resolution of 250 μm
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https://github.com/datalad-datasets/bmmr-t1w-250um
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资源简介:
该数据集包含超高各向同性分辨率250微米的体内人全脑MRI扫描数据,包括原始数据和处理后的数据,以及运动跟踪日志和运动数据分析。
This dataset comprises in vivo human whole-brain MRI scans with an ultra-high isotropic resolution of 250 micrometers. It includes both raw and processed data, along with motion tracking logs and motion data analysis.
创建时间:
2018-07-09
原始信息汇总
T1-weighted in vivo human whole brain MRI dataset with an ultrahigh isotropic resolution of 250 μm
数据集概述
- 分辨率: 250 μm 各向同性分辨率
- 数据组成: 包含原始数据,用于生成平均后的数据集。共有八个体积,每个体积的原始各向同性分辨率为250 μm。此外,还包括首次会话中的PD-weighted GRE,以及同一受试者的1 mm和0.5 mm T1-weighted数据。
- 运动校正: 所有数据均采用前瞻性运动校正技术获取。
数据详细信息
- 运动跟踪日志: 对于250 μm数据,包含原始运动跟踪日志(纯文本格式)。
- 运动数据: 包括平移位移(毫米)和旋转(度)的MAT文件,以及运动图(TIFF格式)。
- 实验设置: 详细信息可参考Stucht et al. (2015)和Maclaren et al. (2012)。
数据结构
- 会话: 分为01至05会话,获取250 μm分辨率数据;06和07会话,分别获取0.5 mm和1 mm数据。
- 文件格式: 序列协议为PDF格式,元数据为JSON格式。
联系信息
- 联系人: Falk Luesebrink
- 联系方式: falk dot luesebrink at ovgu dot de
搜集汇总
数据集介绍

构建方式
该数据集通过超高分辨率T1加权MPRAGE序列采集,采用250微米等向分辨率,涵盖了八个体积的原始数据。数据采集过程中,前瞻性运动校正技术被应用于减少运动伪影,确保图像质量。此外,数据集还包括了同一受试者在不同分辨率(1毫米和0.5毫米)下的T1加权数据,以及PD加权的GRE数据,进一步丰富了数据的多样性和应用场景。
特点
该数据集以其250微米的超高等向分辨率为核心特点,提供了前所未有的脑部结构细节。数据集中包含了运动跟踪日志、平移和旋转的MAT文件,以及运动轨迹的TIFF图像,便于用户直观了解采集过程中的运动情况。此外,每个会话的序列协议和元数据均以PDF和JSON格式提供,确保了数据的透明性和可追溯性。
使用方法
用户可通过访问数据集中的会话文件夹,获取不同分辨率下的T1加权和PD加权图像数据。运动校正相关的日志和MAT文件可用于进一步分析运动对图像质量的影响。序列协议和元数据文件则为用户提供了详细的采集参数和实验设置信息,便于复现和扩展研究。对于任何疑问,用户可直接联系数据集提供者获取支持。
背景与挑战
背景概述
T1-weighted in vivo human whole brain MRI dataset with an ultrahigh isotropic resolution of 250 μm数据集由Falk Luesebrink等人于2015年创建,旨在提供超高分辨率的T1加权磁共振成像(MRI)数据,以支持神经科学和医学影像领域的研究。该数据集通过前瞻性运动校正技术,实现了250微米的各向同性分辨率,为研究人类大脑的微观结构和功能提供了前所未有的细节。数据集包含多个会话的MRI扫描数据,涵盖了不同分辨率的T1加权和PD加权图像,为研究者提供了丰富的实验材料。该数据集的发布极大地推动了高分辨率MRI技术的发展,并为脑科学领域的深入研究奠定了坚实的基础。
当前挑战
该数据集在构建过程中面临的主要挑战包括高分辨率MRI数据的获取和处理。首先,实现250微米的各向同性分辨率需要克服硬件和软件的技术限制,确保扫描过程中的稳定性和精确性。其次,前瞻性运动校正技术的应用对数据质量至关重要,但这也增加了数据采集和处理的复杂性。此外,数据集的构建需要处理大量的原始数据,并进行精确的运动校正和平均化处理,以确保最终数据的准确性和一致性。这些挑战不仅考验了研究团队的技术能力,也为未来高分辨率MRI技术的发展提供了宝贵的经验和参考。
常用场景
经典使用场景
在神经科学研究领域,T1加权MRI数据集以其250微米的超高各向同性分辨率,为研究者提供了前所未有的脑部结构细节。这一数据集常用于探索大脑微观结构的复杂性和异质性,特别是在研究脑部疾病如阿尔茨海默病、帕金森病等神经退行性疾病的早期诊断和病理机制时,提供了高精度的图像支持。
解决学术问题
该数据集解决了神经影像学研究中高分辨率成像的技术难题,尤其是在活体人脑成像中实现超高分辨率的技术挑战。通过前瞻性运动校正技术,有效减少了运动伪影,提高了图像质量,为研究者提供了更准确的脑部结构数据,推动了神经科学领域对脑部微观结构的深入理解。
衍生相关工作
基于该数据集,研究者们开发了多种先进的图像处理和分析工具,如脑部分割算法和运动校正技术。这些工具不仅提升了MRI图像的质量,还为神经科学研究提供了新的方法。此外,该数据集还催生了一系列关于脑部微观结构的研究,推动了神经影像学领域的技术进步和理论创新。
以上内容由遇见数据集搜集并总结生成



