Genomics of Olea europaea cultivars

The files in this collection are supplemental information for the research article "Genomics of Olea europaea cultivars and the questionable nature of PCR marker counts", Richard B. Frost, 2023. Further inquiries can be directed to https://frostconcepts.org/. <br> CONTENT SIZES <br> Ax~=b.zip 8.7 GB Farga FNA Chromosome Data.zip 141.2 MB Farga MX Chromosome Data.zip 275.5 MB Farga TXT Chromosome Data.zip 275.4 MB Koehmstedt Data.zip 483.8 KB Mathematica.zip 429.5 MB Merged Data.zip 19.7 KB Primer Correlations.zip 12.2 GB Primer Displacements.zip 17.2 KB Primer Forms.zip 126.4 MB Primer Locations.zip 1.3 GB Primer Properties.zip 8.6 GB Profile Data.zip 90 KB Profile Distances.zip 369.1 KB Raw Accession Data.zip 1.7 MB README.txt 3.2 KB SSR Motifs.zip 7.1 GB ----------------------------- -------- Total 39.1 GB <br> CONTENT FILE TYPES <br> .zip zipped folders created by 7-Zip File Manager .gz GNU compressed files, can be uncompressed by 7-Zip <br> .csv comma separated values file of tabular data .fna FASTA format chromosome sequence .pdf Adobe PDF .tsv tab separated values file of tabular data .txt ASCII text .xlsx MS Excel worksheet <br> .m auto-generated Mathematica package file .mx can only be read by Mathematica v.12 or greater on Intel i9 platform .nb Mathematica notebook files requiring v.12 or greater <br> Note 1: several tabular files are too large for input to standard spreadsheet programs. <br> Note 2: nearly all .mx files have been converted to .tsv files for generic distribution. <br> Note 3: tabular data files can contain cells with multi-dimension data, delimited by "{", ",", and "}" characters. Further parsing of these files will be necessary to use them in 3rd party software. <br> Note 4: the directory organization for this software is specified in "0000 Olive package". <br> Note 5: origin of a specific file can usually be found with program "0100 Notebook Text Finder". <br> Note 6: novice users of Mathematica should not attempt to modify .nb files. <br> CONTENT ASSOCIATIONS <br> Folder Article section(s) ----------------------------- ----------- Koehmstedt Data.zip 1 Raw Accession Data.zip 4.2.a Profile Data.zip 4.2.b Merged Data.zip 4.2.c Profile Distances.zip 4.3 Farga FNA Chromosome Data.zip 4.5 Farga MX Chromosome Data.zip 4.5 Farga TXT Chromosome Data.zip 4.5 SSR Motifs.zip 4.6 Primer Properties.zip 4.7 Primer Correlations.zip 4.8.1 Primer Locations.zip 4.8.1 Primer Forms.zip 4.8.2.a Ax~=b.zip 4.8.2.c Primer Displacements.zip n/a Mathematica.zip source code <br>本合集内的所有文件均为研究论文《Genomics of Olea europaea cultivars and the questionable nature of PCR marker counts》（作者Richard B. Frost，2023年）的补充资料。如需进一步咨询，请访问https://frostconcepts.org/。 ### 文件大小详情 Ax~=b.zip：8.7 GB Farga FNA Chromosome Data.zip：141.2 MB Farga MX Chromosome Data.zip：275.5 MB Farga TXT Chromosome Data.zip：275.4 MB Koehmstedt Data.zip：483.8 KB Mathematica.zip：429.5 MB Merged Data.zip：19.7 KB Primer Correlations.zip：12.2 GB Primer Displacements.zip：17.2 KB Primer Forms.zip：126.4 MB Primer Locations.zip：1.3 GB Primer Properties.zip：8.6 GB Profile Data.zip：90 KB Profile Distances.zip：369.1 KB Raw Accession Data.zip：1.7 MB README.txt：3.2 KB SSR Motifs.zip：7.1 GB —————————— 总计：39.1 GB ### 文件类型说明 .zip：由7-Zip文件管理器创建的压缩文件夹 .gz：GNU压缩文件，可通过7-Zip解压 .csv：逗号分隔值格式的表格数据文件 .fna：FASTA格式染色体序列文件 .pdf：Adobe可移植文档格式（PDF）文件 .tsv：制表符分隔值格式的表格数据文件 .txt：ASCII文本文件 .xlsx：Microsoft Excel电子表格文件 .m：自动生成的Mathematica软件包文件 .mx：仅可在搭载Intel i9处理器且安装Mathematica v12及以上版本的平台上读取的文件 .nb：需Mathematica v12及以上版本支持的Mathematica笔记本文件 #### 注意事项 注意1：部分表格文件体积过大，无法在标准电子表格软件中加载。 注意2：绝大多数.mx文件已转换为.tsv文件，以实现通用分发。 注意3：表格数据文件可能包含由"{"",""}"字符分隔的多维数据单元格，若需在第三方软件中使用此类文件，需对其进行进一步解析处理。 注意4：本数据集的目录组织结构详见"0000 Olive package"。 注意5：特定文件的来源通常可通过程序"0100 Notebook Text Finder"查询。 注意6：Mathematica新手用户请勿尝试修改.nb格式文件。 ### 文件关联说明 | 压缩包名称 | 对应文章章节 | | --- | --- | Koehmstedt Data.zip | 1 Raw Accession Data.zip | 4.2.a Profile Data.zip | 4.2.b Merged Data.zip | 4.2.c Profile Distances.zip | 4.3 Farga FNA Chromosome Data.zip | 4.5 Farga MX Chromosome Data.zip | 4.5 Farga TXT Chromosome Data.zip | 4.5 SSR Motifs.zip | 4.6 Primer Properties.zip | 4.7 Primer Correlations.zip | 4.8.1 Primer Locations.zip | 4.8.1 Primer Forms.zip | 4.8.2.a Ax~=b.zip | 4.8.2.c Primer Displacements.zip | 不适用（n/a） Mathematica.zip | 源代码

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集是2023年发布的橄榄（Olea europaea）品种基因组学研究补充数据，包含染色体序列、SSR motifs和primer properties等多种文件，总大小约39.1 GB，主要用于支持PCR标记计数相关基因组分析，并关联研究文章的具体章节。