DRTF

DRTF contains 2025 putative transcription factors (TFs) in Oryza sativa L. ssp. indica and 2384 in ssp. japonica, distributed in 63 families, identified by computational prediction and manual curation. It includes detailed annotations of each TF including sequence features, functional domains, Gene Ontology assignment, chromosomal localization, EST and microarray expression information, as well as multiple sequence alignment of the DNA-binding domains for each TF family.DRTF 数据集包含籼稻（Oryza sativa L. ssp. indica）中的2025个推定转录因子（putative transcription factors，TFs），以及粳稻（Oryza sativa L. ssp. japonica）中的2384个推定转录因子；这些转录因子分属63个家族，均通过计算预测结合人工手动注释的方式鉴定得到。本数据集为每个转录因子提供了详尽的注释信息，涵盖序列特征、功能结构域、基因本体（Gene Ontology）注释、染色体定位、表达序列标签（expressed sequence tags, EST）与微阵列（microarray）表达数据，同时还收录了各转录因子家族的DNA结合结构域多序列比对结果。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

DRTF数据集包含水稻籼稻和粳稻亚种的转录因子，分别有2025个和2384个，分布于63个家族，通过计算预测和人工整理鉴定。它提供了每个转录因子的序列特征、功能域、基因本体注释、染色体定位、表达信息以及DNA结合域的多序列比对等详细注释。