基因编辑中DNA损伤修复数据集

CRISPR-Cas9 产生的双链 DNA 断裂 (DSB) 将激活基因组编辑细胞中DNA修复途径。DSB的修复会导致小的插入或缺失（indels）和其他多种的编辑副产物，包括大片段缺失和染色体易位。众所周知，插入缺失会破坏靶基因，而其他副产物的损伤仍然难以捕捉。本数据集为先前描述的引物延伸介导的测序测定开发了一种新方法，以全面评价 CRISPR-Cas9 诱导的人类或小鼠细胞中的 DSB 修复产物。我们发现CRISPR-Cas9 编辑后将产生极有害的DSB 修复副产物，包括大片段缺失、载体随机整合和染色体易位。我们进一步阐明了微同源性、染色体相互作用、DSB 和 DSB 修复途径在这些副产物产生中的重要作用。我们的研究结果为基因组编辑安全提供了除脱靶之外的新维度。在基因组编辑过程中，不仅要避免脱靶损伤，还要避免基因组中产生的有害修复副产物。