sciPlex dataset

<i>Transcriptomes of 650000 A549, K562, and mCF7 cells exposed to 188 compounds.</i><br><br><i> sci-Plex was used to screen three well-characterized human cancer cell lines, A549</i><br><i> (lung adenocarcinoma), K562 (chronic myelogenous leukemia), and MCF7 (mammary</i><br><i> adenocarcinoma)exposed to 188 compounds, profiling ~650,000 single-cell</i><br><i> transcriptomes across ~5000 independent samples in one experiment.</i><br><br><i> References:</i><br><i> Publication: https://doi.org/10.1126/science.aax6234 \</i><br><i> Obtained from scperturb: http://projects.sanderlab.org/scperturb/</i>

650,000个经188种化合物处理的A549、K562及mCF7细胞的转录组（transcriptome）。

本研究采用sci-Plex技术，对三种经过充分表征的人源癌细胞系展开筛选：A549细胞（肺腺癌细胞）、K562细胞（慢性髓系白血病细胞）以及MCF7细胞（乳腺腺癌细胞），将其暴露于188种化合物中，并在单次实验中对约5000个独立样本的约65万个单细胞转录组进行了分析。

参考文献：
发表文献：https://doi.org/10.1126/science.aax6234
数据来源：scperturb数据库：http://projects.sanderlab.org/scperturb/

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

sciPlex dataset是一个包含约650,000个A549、K562和mCF7细胞转录组的数据集，这些细胞暴露于188种化合物中，用于研究三种人类癌细胞系的转录组变化。数据集发布于2023-12-01，来源于scperturb项目，并有一个相关的科学出版物。