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SAdb integrates comprehensive gene‐annotation, transcriptomics and proteomics datasets from public RNA‐seq and mass‐spectrometry studies of Staphylococcus aureus biofilms, and provides interactive modules for co‐expression, functional‐module discovery and PPI‐network visualization.

SAdb 整合了源自公共数据库中针对金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)生物被膜开展的RNA测序(RNA-seq)与质谱(mass-spectrometry)研究的全面基因注释、转录组学及蛋白质组学数据集,并提供了用于共表达分析、功能模块挖掘以及蛋白质相互作用(Protein-Protein Interaction, PPI)网络可视化的交互式分析模块。

提供机构:
南京大学
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背景与挑战
背景概述
SAdb整合了来自公共RNA测序和质谱研究的金黄色葡萄球菌生物膜的基因注释、转录组学和蛋白质组学数据。它提供交互式模块,用于共表达分析、功能模块发现和蛋白质相互作用网络可视化。
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