赤桉EcNha1蛋白结构预测与生物信息学分析.分子植物育种

为了深入预测赤桉Nha1的蛋白结构与生物学功能,本研究使用生物信息学的方法对其进行分析。结果显示:该基因所编码蛋白的氨基酸残基数为365个,该蛋白的分子式为C1756H2730N504O648S8,分子量为41.5 kD,蛋白等电点pI为4.27,带正电残基（Arg+Lys）为41个,带负电残基（Asp+Glu）为105个,不稳定系数为76.45,脂肪系数为59.48,总平均亲水性系数为-1.270;Nha1蛋白含有一个保守域Leo1;二级结构显示该蛋白主要由56.44%的无规则卷曲、25.21%的α-螺旋、15.89%的延伸链和2.47%的β-转角组成;三级结构的预测结果显示含有α-螺旋和β-转角;该蛋白定位于细胞核中,不存在信号肽序列,为非分泌性亲水蛋白,没有跨膜蛋白,共有19个磷酸化位点;进化树分析表明EcNha1蛋白是赤桉蛋白LEO1的同源体。结果为后续深入了解植物Nha1基因作用机制和赤桉EcNha1基因生物学功能研究提供参考。