PPI (Protein-Protein Interactions (PPI))

蛋白质的作用——就它们的细胞功能而言
基因本体——在各种蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 图中，每个图对应
到不同的人体组织[41]。使用位置基因组，基序基因组和免疫
作为特征的签名和作为标签的基因本体集（总共 121 个），从 Molecular
签名数据库 [34]。平均图包含 2373 个节点，平均度数为 28.8。

The roles of proteins, in terms of their cellular functions:
Gene Ontology. In various protein-protein interaction (PPI) networks, each network corresponds to a distinct human tissue [41]. Positional genomic, motif genomic, and immune signatures were used as features, while a total of 121 Gene Ontology term sets were employed as labels, all obtained from the Molecular Signatures Database [34]. On average, each network contains 2,373 nodes and has an average degree of 28.8.

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

PPI数据集是一个用于蛋白质-蛋白质相互作用研究的图网络数据集，基于不同人体组织的PPI图构建，平均每个图包含约2373个节点和28.8的平均度数。数据集使用位置基因组、基序基因组和免疫签名作为特征，并以121个基因本体集作为标签，适用于图分类任务，源自斯坦福大学2018年的研究。