SynLethDB: synthetic lethality database towards discovery of selective and sensitive anticancer drug targets

This dataset is used in the SynLethDB which is the first comprehensive database that harbours a large set of synthetic lethality (SL) gene pairs collected from a variety of sources including biochemical assays, other related databases, computational predictions and text mining. In total, SynLethDB contains 34,085 synthetic lethality pairs and 3,314 publications. Current version covers human and 4 model species, i.e. mouse, fruit fly, worm and yeast.

本数据集应用于SynLethDB，该数据库是首个综合性合成致死基因对数据库，其收录了从多种来源采集的大量合成致死（synthetic lethality, SL）基因对，来源包括生化实验、其他相关数据库、计算预测结果以及文本挖掘成果。总计，SynLethDB共包含34085条合成致死基因对与3314篇相关文献。当前版本覆盖人类及4种模式生物，即小鼠、果蝇、线虫与酵母。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集是SynLethDB数据库的核心组成部分，专门收集合成致死性基因对，以支持选择性抗癌药物靶点的发现。其特点是数据来源多样（包括实验、数据库、预测和文本挖掘），涵盖34,085个基因对和3,314篇出版物，覆盖人类及小鼠等四种模型物种，为抗癌研究提供了全面资源。