scBrainMap

Here, we developed scBrainMap, a database for brain cell types and associated genetic markers for several species. The current scBrainMap database contains 4881 cell types with 26 044 genetic markers identified from 6 577 222 single cells, which link to 14 species, 124 brain regions and 20 different disease states. scBrainMap enables users to perform customized, cross-linked, biologically relevant queries for different cell types of interest.

本研究开发了scBrainMap数据库，一款面向多物种的脑细胞类型及其关联遗传标记（genetic marker）的专用数据库。当前的scBrainMap数据库共收录4881种脑细胞类型、26044个遗传标记，这些标记均从6577222个单细胞（single cell）中鉴定得到，覆盖14个物种、124个脑区以及20种不同的疾病状态。scBrainMap支持用户针对目标脑细胞类型开展定制化、跨关联且具备生物学相关性的精准查询。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

scBrainMap是一个专注于脑细胞类型和相关遗传标记的数据库，涵盖14个物种、124个脑区和20种疾病状态，包含4881种细胞类型和26044个遗传标记数据，支持用户进行跨链接的生物相关性查询。