遇见数据集
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stSNV is a comprehensive spatial mutation atlas documenting 898,908 SNVs across 42,202 genes from 730,067 spatial spots in 19 diseased and 28 normal human/mouse tissues. It provides in-depth analyses of SNV perturbations (e.g., gene expression, cell communication, mutant signatures) and offers interactive tools for exploring SNV-cell co-localization and intra-tissue heterogeneity.

空间单核苷酸变异图谱(stSNV)是一款综合性的空间突变全景数据集,涵盖了来自19种病变组织与28种正常人类/小鼠组织的730,067个空间位点中,42,202个基因上的898,908个单核苷酸变异(Single Nucleotide Variant, SNV)。该数据集针对单核苷酸变异的扰动效应(如基因表达、细胞通讯、突变特征)开展了深入分析,并提供交互式工具以支持单核苷酸变异-细胞共定位与组织内异质性的探索研究。

提供机构:
哈尔滨医科大学
搜集汇总
数据集介绍
stSNV 数据集图片
背景与挑战
背景概述
stSNV是一个综合性空间突变图谱资源,记录了人类和小鼠组织中898,908个单核苷酸变异,覆盖42,202个基因和730,067个空间点,涉及36种疾病和39种正常组织。它提供多层次分析,包括SNV对基因表达的扰动、细胞共定位和空间通信,并配备了用户友好的交互式工具,以探索空间转录组中的变异功能。
以上内容由遇见数据集搜集并总结生成
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