StreptomeDB

StreptomeDB 4.0 contains over 8500 NPs originating from ∼3900 streptomycetes, manually annotated from ∼7600 PubMed-indexed peer-reviewed articles. The database was enhanced by two in-house developments: (i) automated literature-mined NP-protein relationships (hyperlinked to the CPRiL web server) and (ii) pharmacophore-based NP-protein interactions (predicted with the ePharmaLib dataset).链霉菌天然产物数据库4.0（StreptomeDB 4.0）收录逾8500种天然产物（Natural Products，简称NPs），这些产物源自约3900株链霉菌，所有数据均从约7600篇被PubMed收录的同行评议学术文献中手动注释获取。该数据库依托两项自研技术实现升级：其一为自动化文献挖掘得到的天然产物-蛋白质关联关系（已超链接至CPRiL网站服务器）；其二为基于药效团的天然产物-蛋白质相互作用预测结果（基于ePharmaLib数据集完成预测）。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

StreptomeDB 4.0是一个链霉菌天然产物的综合数据库，收录了超过8500种来自约3900种链霉菌的天然产物，数据源自约7600篇PubMed索引文章。数据库通过自动化文献挖掘和药效团预测，增强了天然产物与蛋白质相互作用的分析能力。