2017-2020年长春地区犬细小病毒的检测及可视化LAMP检测方法的建立数据集

对77个不同犬细小病毒全基因组数据比对，从中找出一段433bp长的高度保守序列，作为检测对象。通过基因合成得到含该序列的质粒，制备1×103、1×102、1×101拷贝/μL浓度的质粒作为标准品，并设计一套能扩增这段序列的LAMP引物.首先采用实时荧光定量LAMP扩增，确定了设计的引物能够扩增质粒标准品，最低检测浓度为1×101拷贝/μL。然后使用pH敏感指示剂中性红进行可视化LAMP扩增检测，肉眼观察到扩增反应液变为紫红色即判断为阳性，最低检测浓度同样为1×101拷贝/μL。随后采用实时荧光定量LAMP和可视化LAMP测试了50份犬细小病毒疑似临床DNA样品，检测出阳性样品35个，与国标诊断结果完全吻合。将阳性样品扩增后测序，经比对，确定为犬细小病毒序列。对金黄色葡萄球菌、宋内志贺氏菌、坂崎肠杆菌、丹增李斯特菌、大肠杆菌DNA进行扩增，结果均为阴性，证明了该方法的特异性。