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PlantCADB contains 18,339,426 accessible chromatin regions (ACRs) from more than 600 samples of 37 species. These ACRs were annotated with genomic information, associated genes, transcription factors footprint, motif and SNPs.

PlantCADB 数据库包含18,339,426个开放染色质区域(accessible chromatin regions,ACRs),其数据覆盖37个物种的600余个样本。所有ACRs均已完成注释,注释内容涵盖基因组信息、关联基因、转录因子足迹、基序以及单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)。

提供机构:
东北林业大学
搜集汇总
数据集介绍
PlantCADB 数据集图片
背景与挑战
背景概述
PlantCADB是一个综合性的植物染色质可及性数据库,收录了来自37个物种、超过600个样本的1833.9万个可及染色质区域(ACRs)。这些ACRs均经过基因组信息、关联基因、转录因子足迹、基序和SNP等注释,并提供了可视化工具,以支持植物发育、生理和胁迫适应等遗传调控网络的研究。
以上内容由遇见数据集搜集并总结生成
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