Progenetix

The Progenetix database provides an overview of copy number abnormalities in human cancer from Comparative Genomic Hybridization (CGH) experiments. Progenetix is the largest curated database for whole genome copy number profiles in cancer. The current dataset contains more than 130'000 profiles from genomic CNV screening experiments. This data covers 700 diagnostic entities according to the NCIt Neoplasm Core and the International Classification of Disease in Oncology (ICD-O 3). Additionally, the website attempts to lists all publications referring to cancer genome profiling experiments.Progenetix数据库提供了基于比较基因组杂交（Comparative Genomic Hybridization，CGH）实验得到的人类癌症拷贝数异常全景概览。Progenetix是全球规模最大的癌症全基因组拷贝数特征人工注释数据库。当前数据集包含超过130000条来自基因组拷贝数变异（Copy Number Variation，CNV）筛选实验的拷贝数特征谱数据。该数据集覆盖了依据美国国家癌症研究所叙词表（NCIt）肿瘤核心子集以及《国际肿瘤学疾病分类第3版（ICD-O 3）》划定的700种肿瘤诊断实体。此外，该数据库官网还致力于收录所有涉及癌症基因组特征分析实验的相关学术文献。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

Progenetix是一个专注于人类癌症拷贝数异常（CNV/CNA）的数据库，基于超过25万个样本数据，涵盖1129种癌症类型。它提供全基因组CNV谱分析、频率可视化以及相关癌症基因组筛查出版物的参考信息，适用于癌症基因组研究。