RiceNCexp

RiceNCexp characterizes rice ncRNA co-expression based on 491 RNA-seq and 274 small RNA (sRNA)-seq datasets. RiceNCexp hosts four types of ncRNAs, namely lncRNAs, PHAS genes, miRNAs, and phasiRNAs. RiceNCexp provides comprehensive expression information for rice ncRNAs in 22 tissues/organs, tissue-specific ncRNAs, and the robust co-expression analysis among ncRNAs or between ncRNAs and protein-coding genes.RiceNCexp 数据集基于491份RNA测序（RNA-seq）与274份小RNA测序（small RNA-seq，简称sRNA-seq）数据集，解析了水稻非编码RNA（non-coding RNA，ncRNA）的共表达特征。该数据集涵盖四类非编码RNA，分别为长链非编码RNA（long non-coding RNAs，lncRNAs）、PHAS基因、微RNA（microRNAs，miRNAs）以及相位次级小干扰RNA（phased secondary small interfering RNAs，phasiRNAs）。RiceNCexp 提供了水稻22种组织/器官中非编码RNA的全面表达谱信息、组织特异性非编码RNA数据，以及非编码RNA之间或非编码RNA与蛋白编码基因之间的稳健共表达分析结果。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

RiceNCexp是一个基于491个RNA-seq和274个小RNA-seq数据集的水稻非编码RNA共表达图谱资源。它涵盖了lncRNA、PHAS基因、miRNA和phasiRNA四种非编码RNA类型，提供了在22种组织/器官中的全面表达信息，并支持非编码RNA之间或与蛋白编码基因之间的稳健共表达分析。