mouse_cerebellum_data.tar.gz
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资源简介:
Gene annotation files, R notebooks, gene expression matrices from Vladoiu et al. (2019), analyzed results including figures (UMAPs, dotplots, dendrograms, etc.), tables (marker genes, gene expression clusters) and intermediate R files.<br><br>Download, unpack, then edit the first block in each R notebook to update the path for "mydir" to point to your download location.<br>md5sum mouse_cerebellum_data.tar.gz 162c8914005762238e1234f9c8319284 mouse_cerebellum_data.tar.gz
本数据集包含Vladoiu等人2019年研究中的基因注释文件、R笔记(R notebooks)、基因表达矩阵;同时涵盖分析所得结果,具体包括可视化图表(如均匀流形近似与投影(UMAP)图、点图、树状图等)、表格(如标记基因表、基因表达聚类表)以及中间生成的R文件。 请下载并解压该数据集,随后编辑每份R笔记中的首个代码块,将其中"mydir"对应的路径更新为您的本地下载目录路径。 该压缩包mouse_cerebellum_data.tar.gz的MD5校验值为162c8914005762238e1234f9c8319284。
提供机构:
figshare创建时间:
2024-11-25
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数据集介绍

背景与挑战
背景概述
该数据集是用于小鼠小脑研究的单细胞RNA测序(scRNA-seq)实验数据包,包含基因注释文件、R笔记本、基因表达矩阵和分析结果(如UMAP图、标记基因表等),主要用于生物网络分析。数据集基于Vladoiu等人2019年的研究,使用Seurat工具进行处理,大小为7.3 GB,采用CC BY 4.0许可,便于科研人员下载并自定义路径进行后续分析。
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