微生物群落结构对水母消亡过程的应答实验数据集
收藏国家地球系统科学数据中心2018-12-19 更新2024-04-21 收录
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资源简介:
本研究将PCR 、克隆文库构建与生物信息学分析相结合, 采用模拟生态学方法,分析了海蜇消亡过程对表层沉积物微生物群落结构的影响。沿海蜇消亡过程设置了5个采样时间点,获得了495个16S rDNA基因克隆子,隶属于372个OTUs,其中T0 含有的OTUs最少(69个),T3 含有的OTUs最多(93个)。丰富度和多样性分析显示,海蜇消亡过程对表层沉积物微生物群落的丰富度和多样性影响强烈:沿着海蜇消亡时间,丰富度指数(Chao和ACE)和多样性指数(H’和1/ D)均呈现先增加,再逐渐回落的趋势。其中T1-T2丰富度和多样性变化最为强烈,T1的ACE是T0的4.73倍,T2的1/ D是T0的18.13倍。系统进化分析表明, 沿海蜇消亡过程,表层沉积物主要优势群落的演替规律明显:γ-变形菌在T0的丰度最高(74.0%),随着海蜇的消亡,丰度逐渐下降,到T4时丰度最低,仅为12.6%;δ-变形菌正好相反,随着海蜇的消亡,其丰度逐渐增加,T4时的丰度是T0的4.68倍。表层次优势群落也呈现类似规律。
提供机构:
中国水产科学研究院黄海水产研究所
创建时间:
2015-08-28



