scAPAdb

scAPAdb provides a comprehensive and manually curated atlas of poly(A) sites, APA events and poly(A) signals at the single-cell level in six species based on a large volume of scRNA-seq data.scAPAdb 提供了一套基于大规模单细胞RNA测序（single-cell RNA sequencing, scRNA-seq）数据的、覆盖六个物种的单细胞水平的多聚腺苷酸化位点（poly(A) site）、可变多聚腺苷酸化（alternative polyadenylation, APA）事件及多聚腺苷酸化信号（poly(A) signal）的全面且经人工手动整理注释的图谱。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

scAPAdb是一个基于大规模单细胞RNA测序数据构建的综合性图集，专注于单细胞水平的poly(A)位点、APA事件和poly(A)信号分析，涵盖人类、小鼠和多种植物等六种物种。它提供了详细的APA信息，包括poly(A)位点表达、APA使用情况和3' UTR长度等单细胞层面数据。