footprintDB

FootprintDB integrates some of the most comprehensive freely available libraries of curated DNA binding sites and systematically annotates the binding interfaces of the corresponding TFs.FootprintDB 整合了一批当前最为全面的可免费获取的经人工整理注释的DNA结合位点（DNA binding site）文库，并对对应转录因子（Transcription Factors, TFs）的结合界面开展了系统性注释。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

footprintDB是一个整合了公共数据库和文献中DNA结合位点数据的资源库，通过3D-footprint的蛋白质-DNA复合物数据系统注释转录因子的结合界面。它包含超过1万个转录因子和大量DNA基序与结合位点，主要用于预测与特定DNA位点结合的转录因子，以及识别DNA结合蛋白可能结合的DNA基序或位点。