Smillie2019 SCP259 colon epithelium and lamina propria ulcerative colitis dataset for Besca

The gene expression matrix and metadata were downloaded the Single Cell Portal of the Broad Institute (https://singlecell.broadinstitute.org/single_cell/study/SCP259/intra-and-inter-cellular-rewiring-of-the-human-colon-during-ulcerative-colitis), originally published by Smillie CS, Biton M, Ordovas-Montanes J, et al. Intra- and Inter-cellular Rewiring of the Human Colon during Ulcerative Colitis. Cell. 2019;178(3):714-730.e22. doi:10.1016/j.cell.2019.06.029. We reprocessed the dataset using the Besca package (https://github.com/bedapub/besca).本数据集的基因表达矩阵与元数据（metadata）下载自布罗德研究所（Broad Institute）的单细胞门户（Single Cell Portal，网址：https://singlecell.broadinstitute.org/single_cell/study/SCP259/intra-and-inter-cellular-rewiring-of-the-human-colon-during-ulcerative-colitis），该数据集最初由Smillie CS、Biton M、Ordovas-Montanes J等学者发表于《Cell》期刊的论文《溃疡性结肠炎进程中人类结肠的细胞内与细胞间调控网络重连》（2019年；178(3):714-730.e22；DOI: 10.1016/j.cell.2019.06.029）。本研究使用Besca软件包（Besca package，网址：https://github.com/bedapub/besca）对该数据集进行了重新处理。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集是基于Smillie等人2019年发表在《Cell》期刊上的单细胞研究，专注于人类结肠在溃疡性结肠炎期间的上皮和固有层细胞重连，原始数据来自Broad Institute的SCP259。数据集经过Besca包重新处理，适用于Besca用户，数据量约为135.3 GB，发布于2020年7月26日，状态为受限访问。