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TFM - Modelado generativo de cadenas laterales de proteínas mediante difusión torsional en espacios no euclidianos

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Zenodo2026-06-02 更新2026-06-12 收录
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ChiGNN: Artefactos del TFM "Modelado Generativo de Cadenas Laterales de Proteínas mediante Difusión Torsional en Espacios No Euclidianos" Este depósito contiene los artefactos computacionales generados durante el desarrollo del Trabajo Final de Máster del Máster Universitario en Bioinformática y Bioestadística (UOC, 2026). Se incluyen tres archivos: el dataset curado de 597 proteínas de alta resolución (<2,0 Å) extraídas de PDB-REDO en formato PyTorch Geometric (dataset_torsional_diffusion.pt), su versión tabular legible con coordenadas de backbone y ángulos diedros χ₁–χ₄ por residuo (dataset_sidechains_curated.csv), y el checkpoint del modelo ChiGNN correspondiente al mejor epoch del entrenamiento (chignn_best.pt, época 42, val_loss = 0,0885). El código fuente completo está disponible en GitHub: https://github.com/noeliafernandezesp/torsional-diffusion-sidechain

提供机构:
Zenodo
创建时间:
2026-06-02
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