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Chickpea Transcriptome Database

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re3data.org2024-05-31 收录
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资源简介:
The Chickpea Transcriptome Database (CTDB) has been developed with the view to provide most comprehensive information about the chickpea transcriptome, the most relevant part of the genome. The database contains various information and tools for transcriptome sequence, functional annotation, conserved domain(s), transcription factor families, molecular markers (microsatellites and single nucleotide polymorphisms), Comprehensive gene expression and comparative genomics with other legumes. The database is a freely available resource, which provides user scientists/breeders a portal to search, browse and query the data to facilitate functional and applied genomics research in chickpea and other legumes. The current release of database provides transcriptome sequence from cultivated (Cicer arietinum desi (ICC4958) and kabuli (ICCV2)) and wild (Cicer reticulatum, PI489777) chickpea genotypes.

豆科植物转录组数据库(CTDB)旨在提供关于鹰嘴豆转录组最为详尽的信息,转录组是基因组中最具相关性的部分。该数据库囊括了转录组序列、功能注释、保守结构域、转录因子家族、分子标记(包括微卫星和单核苷酸多态性)、全面的基因表达及与其他豆科植物的比较基因组学等多方面的信息和工具。作为一个免费资源,该数据库为科研人员和育种者提供了一个搜索、浏览和查询数据的平台,以促进鹰嘴豆及其他豆科植物在功能基因组学和应用基因组学领域的研究。当前数据库版本提供了栽培鹰嘴豆(Cicer arietinum desi (ICC4958) 和 kabuli (ICCV2))及野生鹰嘴豆(Cicer reticulatum, PI489777)的转录组序列。
提供机构:
CTDB
5,000+
优质数据集
54 个
任务类型
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