DanielHesslow/SwissProt-Pfam
收藏Hugging Face2022-04-30 更新2024-03-04 收录
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https://hf-mirror.com/datasets/DanielHesslow/SwissProt-Pfam
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资源简介：
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language:
- protein sequences
datasets:
- Swissprot
tags:
- Protein
- PFam
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Swissprot is a high quality manually annotated protein database. The dataset contains annotations with the functional properties of the proteins. Here we extract proteins with PFam labels.
The dataset is ported from Protinfer: https://github.com/google-research/proteinfer.
The Pfam-labels are extracted and indexed, the mapping is provided in `idx_mapping.json`. Proteins without Pfam tags are removed.
提供机构：
DanielHesslow
原始信息汇总
数据集概述
数据集名称
- Swissprot
数据集内容
- 包含高质量手动注释的蛋白质序列数据。
- 数据集中的蛋白质具有PFam标签，用于描述其功能属性。
数据集处理
- 从Protinfer项目中提取，地址为：https://github.com/google-research/proteinfer。
- 蛋白质序列中未包含PFam标签的部分已被移除。
- 提供了一个名为
idx_mapping.json的文件，用于映射和索引PFam标签。
数据集标签
- Protein
- PFam
