PotatoBSLnc

PotatoBSLnc integrates 18 636 lncRNAs, 44 263 mRNAs and their differential-expression, GO/KEGG and cis/trans-target analyses across 12 biotic stresses and 26 potato cultivars, offering interactive modules for browsing, expression profiling and stress-specific exploration.PotatoBSLnc 数据集整合了18636条长链非编码RNA（long non-coding RNA, lncRNA）、44263条信使RNA（messenger RNA, mRNA），以及覆盖12种生物胁迫与26个马铃薯栽培品种的差异表达分析、基因本体（Gene Ontology, GO）/京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG）功能富集分析及顺式/反式靶标分析；该数据集提供了用于浏览、表达谱分析与胁迫特异性探索的交互式功能模块。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

PotatoBSLnc是一个专注于马铃薯生物胁迫相关长链非编码RNA（lncRNAs）的综合数据库，整合了364个RNA-seq数据，涵盖12种胁迫类型和26个品种。该数据库包含超过1.8万个lncRNAs和4.4万个mRNAs，提供表达信息、差异表达分析、靶基因预测以及GO/KEGG功能注释等交互式模块。