BloodChIP Xtra

BloodChIP Xtra is a user-friendly database that facilitates genome-wide exploration and visualization of transcription factor (TF) occupancy and chromatin configuration in rare primary human hematopoietic stem (HSC-MPP) and progenitor (CMP, GMP, MEP) cells and acute myeloid leukemia (AML) cell lines (KG-1, ME-1, Kasumi1, TSU-1621-MT), along with chromatin accessibility and gene expression data from these and primary patient AMLs. An interactive web interface allows users to explore the regulatory landscape of any gene across multiple blood cell types, and then associate the epigenetic/regulatory profile with gene expression across healthy and leukemic cells. All queries, as well as the complete database, can be exported by the user for further data analysis.BloodChIP Xtra 是一款操作便捷的数据库，可助力全基因组范围内的探索与可视化，涵盖罕见原代人造血干细胞（HSC-MPP）、祖细胞（CMP、GMP、MEP）及急性髓系白血病（acute myeloid leukemia, AML）细胞系（KG-1、ME-1、Kasumi1、TSU-1621-MT）中的转录因子（transcription factor, TF）结合位点与染色质构象；同时收录上述细胞系及原代患者AML样本的染色质可及性与基因表达数据。该数据库配备交互式网页界面，支持用户跨多种血细胞类型探索任意基因的调控图谱，并可将表观遗传/调控特征与健康及白血病细胞中的基因表达水平进行关联分析。用户可导出所有查询结果及完整数据库，用于后续数据分析。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

BloodChIP Xtra是一个用户友好的数据库，支持在全基因组范围内探索和可视化人类造血干细胞/祖细胞及急性髓系白血病细胞系中的转录因子占据和染色质构型，并整合了染色质可及性与基因表达数据。它通过交互式网络界面允许用户跨多种血细胞类型分析基因的调控景观，并关联表观遗传/调控特征与基因表达，所有查询和数据库均可导出以供进一步分析。