NMDC-EDGE

NMDC-EDGE is a free, cloud-backed web application that lets any researcher process metagenome, metatranscriptome, metaproteome and natural-organic-matter datasets with production-quality, containerised workflows developed by the U.S. DOE National Microbiome Data Collaborative, returning standardized outputs, visual summaries and provenance records ready for FAIR deposition.NMDC-EDGE 是一款免费的云支撑型Web应用程序，面向所有研究人员提供宏基因组（metagenome）、宏转录组（metatranscriptome）、宏蛋白质组（metaproteome）及天然有机物（natural-organic-matter）数据集的处理服务。该应用采用美国能源部（U.S. DOE）国家微生物组数据协作中心开发的生产级容器化工作流，可返回标准化输出结果、可视化摘要与溯源记录，所有产出均可直接用于符合FAIR（可发现、可访问、可互操作、可复用）原则的数据存档。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

NMDC-EDGE是一个免费的云支持网络应用，由美国能源部国家微生物组数据协作组织开发，提供标准化的生物信息学工作流程，用于处理宏基因组、宏转录组等多组学数据，并生成符合FAIR原则的输出。目前，该平台已停止接受新项目，但用户可浏览旧项目至2027年，并鼓励将数据迁移至NMDC数据门户以确保持续访问。