expam

Shot弹枪宏基因组测序提供了以前所未有的分辨率了解微生物群落结构和功能的能力; 但是，当前的分析方法受到对可能混淆功能关系的分类学分类的关注的限制。在这里，我们介绍了expam，这是一种基于树的分类学不可知的工具，用于从shot弹枪宏基因组测序中鉴定生物学相关的进化枝。expam是根据GNU通用公共许可证v3.0发布的开源Python应用程序。expam安装说明，源代码和教程可以在https://github.com/seansolari/expam. 找到补充数据可在生物信息学在线上获得。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

expam是一个基于树的分类学不可知工具，用于分析shot弹枪宏基因组测序数据以鉴定生物学相关的进化枝。该开源Python应用程序遵循GPL-3.0许可证，由莫纳什大学·哈德逊医学研究所在2022年发布。