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Mus_musculus.GRCm38.102.IRLAB20220421.gtf.gz

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DataCite Commons2025-06-01 更新2024-07-29 收录
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资源简介:
Mouse genome GRCM38/mm10 annotation adapted from Ensembl version 102 with updated V1R, V2R, FPR and OR 3' UTRs and newly identified pseudogenic sequences of V1R, V2R and FPR. <br> This file a raw text file encoded in UTF-8, with Unix newline characters and was gzipped (MD5 sum of the .gz = 4cf9f33d2363a54d3458c2bc08571bf3). The content is a genome annotation in GTF format (https://en.wikipedia.org/wiki/Gene_transfer_format)

本数据集为基于Ensembl版本102改编的小鼠基因组GRCM38/mm10注释文件,其中已更新V1R、V2R、FPR及OR的3'非翻译区(3' Untranslated Region),并新增了新鉴定的V1R、V2R与FPR假基因序列。 本文件为UTF-8编码的纯文本文件,采用Unix换行符格式,并经gzip压缩(压缩后的.gz文件的MD5校验和为4cf9f33d2363a54d3458c2bc08571bf3)。 其内容为GTF(Gene Transfer Format,基因转移格式)格式的基因组注释文件,相关规范可参考https://en.wikipedia.org/wiki/Gene_transfer_format。
提供机构:
figshare
创建时间:
2022-08-24
搜集汇总
数据集介绍
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背景与挑战
背景概述
该数据集是一个小鼠基因组GRCM38/mm10的注释文件,基于Ensembl版本102进行了更新,特别关注了V1R、V2R、FPR和OR的3' UTRs以及伪基因序列的识别。文件以GTF格式提供,并经过gzip压缩处理。
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