Differential expression data
收藏doi.org2025-03-23 收录
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http://doi.org/10.17632/c9zwjncxb4.1
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De novo transcriptome assembly of two halophytes, Dichanthium annulatum (moderately salt tolerant) and Urochondra setulosa (highly salt tolerant) were generated on Illumina- Hi Seq platform at salinity levels of ECe ~30, ~40 and ~50 dS/m. Differential expression of transcripts was analyzed using DESeq and novel gene expression patterns of the differentially expressed genes (DEGs) related to salinity/salt tolerance was identified and validated using qPCR.
对两种耐盐植物，即中等耐盐性的 Dichanthium annulatum 和高度耐盐性的 Urochondra setulosa 的转录组进行了从头组装，该组装是在 Illumina Hi Seq 平台上，在 ECe 约为 30、40 和 50 dS/m 的盐度条件下完成的。通过 DESeq 软件对转录本的差异表达进行了分析，并确定了与盐度/耐盐性相关的差异表达基因（DEGs）的新型基因表达模式，并通过实时定量PCR技术进行了验证和确认。
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doi.org
