dbHERV-REs

dbHERV-REs is a database of HERV/LTR regulatory elements. The database provides (i) general information on HERV/LTRs such as family classification, copy number, and insertion date judged by distribution of orthologous copies among mammalian genome; (ii) positions of HERV-TFBSs, HSREs, and HERV-DHSs in the consensus sequence of HERV/LTRs and in human reference genome; and (iii) results of Gene ontology (GO) enrichment analyses with GREAT using sets of respective HSREs.dbHERV-REs是一个收录人类内源性逆转录病毒/长末端重复序列（HERV/LTR）调控元件的专业数据库。该数据库提供三类核心信息：（1）人类内源性逆转录病毒/长末端重复序列的基础概况，涵盖家族分类、拷贝数，以及通过哺乳动物基因组中同源拷贝的分布特征推断得到的插入时间；（2）人类内源性逆转录病毒转录因子结合位点（HERV-TFBS）、HSREs以及人类内源性逆转录病毒相关DNA酶I超敏位点（HERV-DHS）在人类内源性逆转录病毒/长末端重复序列共有序列与人类参考基因组中的位置信息；（3）采用GREAT基因组区域注释富集工具，针对各HSREs集合开展的基因本体（GO）富集分析结果。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

dbHERV-REs是一个专注于HERV/LTR调控元件的数据库，它整合了HERV/LTR的家族分类、拷贝数、插入时间等基本信息，以及HERV-TFBSs、HSREs和HERV-DHSs在基因组中的具体位置。此外，数据库还包含了基于GREAT工具进行的基因本体富集分析结果，为研究HERV/LTR的调控功能提供了全面的资源支持。