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Hieracium 2016 genome browser data

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DataCite Commons2023-07-26 更新2025-04-09 收录
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https://data.csiro.au/collection/csiro%3A59692v1
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Input data from a GBrowse and Sequence Server setup, representing Hieracium species genome and RNA sequencing assemblies and alignments. Data is from a study of apomixis, generated by the Asexual Seed Formation research team in CSIRO led by Anna Koltunow and originally published in 2016. Includes GFF files, FASTA files and BLAST database files. The data supported the publication : Generation of an integrated Hieracium genomic and transcriptome resource enables exploration of small RNA pathways during apomixis initiation David S. Rabiger, Jennifer M. Taylor, Andrew Spriggs, Melanie L. Hand, Steven T. Henderson, Susan D. Johnson, Karsten Oelkers1, Maria Hrmova, Keisuke Saito, Go Suzuki, Yasuhiko Mukai, Bernard J. Carroll and Anna M.G. Koltunow BMC Biology 2016

本数据集源自GBrowse(基因组浏览器)与Sequence Server(序列服务器)的搭建配置,涵盖山柳菊属(Hieracium)物种的基因组与RNA测序组装及比对结果。该数据取自一项无融合生殖(apomixis)相关研究,由Anna Koltunow领衔的CSIRO无性种子形成研究团队生成,并于2016年首次发表。数据集包含GFF(通用特征格式)文件、FASTA(序列格式)文件以及BLAST(基本局部比对搜索工具)数据库文件。本数据为以下发表论文提供了支撑:《整合型山柳菊属基因组与转录组资源的构建助力无融合生殖起始过程中小RNA通路的探究》,作者包括David S. Rabiger、Jennifer M. Taylor、Andrew Spriggs、Melanie L. Hand、Steven T. Henderson、Susan D. Johnson、Karsten Oelkers¹、Maria Hrmova、Keisuke Saito、Go Suzuki、Yasuhiko Mukai、Bernard J. Carroll 及 Anna M.G. Koltunow,该论文发表于《BMC Biology》2016年刊。
提供机构:
CSIRO
创建时间:
2023-07-26
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