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Supplementary material

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Mendeley Data2024-01-31 更新2024-06-27 收录
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https://figshare.com/articles/dataset/Supplementary_material/16649839
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Table S01. Metadata. The table provides the SRA experiment identifiers for the reference and Gulf metagenomes, including the related MG-RAST identifier, geographical location, latitude, longitude, depth, library instrument, library layout, and PubMed references. Table S02. PDF describing the annotated enzymes in the reference. The table shows the PDF describing the behavior of each enzyme in the reference metagenomes (normal, log-normal, gamma, and Weibull distributions). Table S03. PDF of enzymes in metabolic pathways. The table shows the PDF describing the behavior of each enzyme in the reference metagenomes for which a metabolic pathway is described. Table S04. EZSs of enzymes found in metabolic pathways. Enzymes with an assigned EZS were classified into the corresponding KEGG BRITE classes and metabolic maps. Table S05. Statistical properties of enzymes grouped into BRITE classes. A summary of the measures of the central tendency and quartiles is shown in the table with the enzymes grouped into the BRITE classes. Table S06. EC equivalences. We show the enzyme names associated with ECs related to the figures in the main text.

表S01 元数据(Metadata)。本表格提供了参考宏基因组与海湾宏基因组的序列读取档案(SRA)实验标识符,包含相关的元基因组快速注释服务器(MG-RAST)标识符、地理位置、纬度、经度、采样深度、测序文库仪器、文库布局以及PubMed数据库(PubMed)参考文献信息。 表S02:参考宏基因组注释酶相关PDF文件。本表格所附的PDF展示了参考宏基因组中各酶的分布特征,涵盖正态分布、对数正态分布、伽马分布与威布尔分布。 表S03:代谢通路相关酶的PDF文件。本表格所附的PDF描述了参考宏基因组中已注释代谢通路的各酶的分布特征。 表S04:代谢通路中发现的酶的EZS值。将被赋予EZS值的酶归类至对应的KEGG BRITE分类体系与代谢通路图谱中。 表S05:按BRITE分类体系分组的酶的统计特性。本表格汇总了按BRITE分类体系分组的酶的集中趋势度量值与四分位数统计信息。 表S06:EC编号等价对应关系。本表格列出了与正文配图相关的酶学委员会(EC)编号对应的酶名称。
创建时间:
2024-01-31
搜集汇总
数据集介绍
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背景与挑战
背景概述
该数据集包含6个补充表格,主要提供关于参考和海湾元基因组的元数据、酶分布特征、代谢途径中的酶行为分析以及相关统计特性。数据集聚焦于生物信息学领域,特别关注代谢潜力、酶等价z分数和代谢途径研究,采用CC BY 4.0许可协议共享。
以上内容由遇见数据集搜集并总结生成
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