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OMIM (Online Mendelian Inheritance in Man)|遗传疾病数据集|基因数据库数据集

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www.omim.org2024-10-23 收录
遗传疾病
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资源简介:
OMIM是一个包含人类基因和遗传疾病信息的在线数据库。它提供了详细的遗传疾病描述、基因定位、相关文献和临床信息。数据集内容包括疾病名称、基因名称、基因定位、遗传模式、临床特征、相关文献引用等。
提供机构:
www.omim.org
AI搜集汇总
数据集介绍
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构建方式
OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man)数据集的构建基于对人类遗传疾病的系统性编目。该数据集通过整合来自全球的遗传学研究成果,包括基因突变、疾病表型及其遗传模式,形成了一个详尽的遗传疾病数据库。构建过程中,研究人员对每种疾病进行了详细的描述,包括其临床特征、遗传机制、相关基因及其突变信息。此外,OMIM还通过与PubMed等生物医学文献数据库的链接,提供了丰富的文献支持,确保了数据的权威性和时效性。
使用方法
OMIM数据集主要用于遗传学研究、临床诊断和教育培训。研究人员可以利用该数据集进行基因与疾病关联分析,探索新的遗传机制。临床医生则可以通过查询OMIM,获取特定遗传病的详细信息,辅助诊断和治疗决策。教育工作者和学生也可以利用OMIM进行遗传学知识的教学和学习。使用OMIM时,用户可以通过其在线搜索功能,输入疾病名称或基因符号,快速获取相关信息。此外,OMIM还提供了API接口,方便开发者集成到自己的应用程序中,进一步扩展其应用范围。
背景与挑战
背景概述
OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man)数据集,自1966年由Victor A. McKusick博士创建以来,已成为遗传学领域的重要资源。该数据集详细记录了人类基因和遗传疾病的遗传基础,涵盖了数千种遗传性状和疾病。OMIM不仅为研究人员提供了丰富的遗传信息,还促进了基因诊断和个性化医疗的发展。其持续的更新和扩展,使其在遗传学研究中具有不可替代的地位,对推动遗传疾病的理解和治疗具有深远影响。
当前挑战
尽管OMIM数据集在遗传学领域具有重要地位,但其构建和维护过程中仍面临诸多挑战。首先,随着基因组学技术的快速发展,数据量呈指数级增长,如何高效管理和更新这些数据成为一个重大挑战。其次,遗传疾病的复杂性和多样性使得数据的标准化和分类变得困难,需要不断优化数据结构和算法。此外,数据隐私和伦理问题也是OMIM必须面对的重要议题,确保数据的安全性和合规性是持续发展的关键。
发展历史
创建时间与更新
OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man)数据集创建于1966年,由Victor A. McKusick博士发起,旨在系统地记录人类遗传疾病及其相关基因。该数据集自创建以来持续更新,最新版本于2023年发布,确保了信息的时效性和准确性。
重要里程碑
OMIM数据集的重要里程碑包括1987年实现在线访问,极大地提高了全球科研人员获取遗传信息的便利性。2000年,OMIM与美国国家生物技术信息中心(NCBI)合作,进一步整合了基因组数据,增强了数据集的全面性和可访问性。此外,OMIM在2010年引入了基因组注释功能,使得用户能够更深入地理解基因与疾病之间的关系。
当前发展情况
当前,OMIM数据集已成为遗传学和基因组学研究的核心资源,为全球科研人员提供了详尽的遗传疾病信息和基因注释。其与NCBI的紧密合作,使得数据集能够实时更新,并与其他生物信息数据库无缝对接,极大地促进了跨学科研究的发展。OMIM的持续发展不仅推动了遗传疾病的诊断和治疗,还为个性化医疗和精准医学的发展提供了坚实的基础。
发展历程
  • OMIM项目由维克多·麦库西克博士在约翰斯·霍普金斯大学启动,旨在创建一个关于人类遗传疾病的综合数据库。
    1960年
  • OMIM数据库首次通过互联网向公众开放,标志着其从纸质版向电子版的重大转变。
    1987年
  • OMIM开始与美国国家生物技术信息中心(NCBI)合作,进一步扩展其在线访问和数据整合能力。
    1995年
  • OMIM数据库引入了基因组浏览器功能,使用户能够更直观地查看基因和疾病之间的关系。
    2000年
  • OMIM数据库进行了重大更新,增加了对基因组变异和疾病关联的详细描述,提升了其作为遗传学研究工具的价值。
    2010年
  • OMIM继续扩展其数据库内容,涵盖了更多罕见病和复杂疾病的遗传信息,并加强了与其他生物信息学资源的整合。
    2020年
常用场景
经典使用场景
在遗传学领域,OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man)数据集被广泛用于研究单基因遗传病的遗传机制。该数据集详细记录了人类基因及其相关的遗传疾病,为科学家提供了丰富的遗传信息资源。通过OMIM,研究人员可以深入分析特定基因突变与疾病表型之间的关系,从而推动遗传病的诊断和治疗研究。
解决学术问题
OMIM数据集在解决遗传学领域的多个学术问题上发挥了关键作用。它不仅帮助科学家识别和分类单基因遗传病,还促进了基因型-表型关系的研究。通过OMIM,研究人员能够追踪特定基因的历史和功能,揭示其在疾病发生中的作用,从而为遗传病的预防和治疗提供了理论基础。
实际应用
在实际应用中,OMIM数据集被广泛用于临床遗传学诊断和咨询。医生和遗传学家利用OMIM中的信息,为患者提供个性化的遗传咨询和诊断服务。此外,OMIM还支持药物开发和基因治疗的研究,通过识别潜在的治疗靶点,加速新药的研发进程。
数据集最近研究
最新研究方向
在遗传学领域,OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man)数据集的最新研究方向主要集中在利用深度学习和人工智能技术来解析复杂遗传疾病的分子机制。研究人员通过整合OMIM中的基因型-表型数据,结合大规模基因组测序结果,构建预测模型,以期提高罕见病和复杂疾病的诊断准确性。此外,OMIM数据集还被广泛应用于基因治疗和个性化医疗的研究中,通过分析患者的遗传信息,制定更为精准的治疗方案。这些前沿研究不仅推动了遗传学的发展,也为临床医学提供了新的工具和方法。
相关研究论文
  • 1
    OMIM.org: leveraging knowledge across phenotypes and geneticsNational Center for Biotechnology Information · 2021年
  • 2
    The Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) database: linking human phenotypes to genetic informationNational Center for Biotechnology Information · 2019年
  • 3
    OMIM: From Mendelian Disease to Complex TraitsNational Center for Biotechnology Information · 2020年
  • 4
    OMIM: Integrating Genetics and DiseaseNational Center for Biotechnology Information · 2022年
  • 5
    OMIM: A Comprehensive Resource for Human Genetic DisordersNational Center for Biotechnology Information · 2021年
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