青藏高原土壤细菌多样性调查（V1.0）（2015）
收藏中国科技资源共享网2026-06-02 更新2026-02-07 收录
下载链接：
https://escience.org.cn/metadata/detail?cstrId=CSTR:18406.11.Ecol.tpe.00000076.file&id=da0e21dd01bcbea6d33bd0c6ce9c2c33:Ecol.tpe.00000076.file
下载链接
链接失效反馈官方服务：
资源简介：
青藏高原土壤细菌多样性数据集提供了青藏高原土壤表层（0-2厘米）微生物分布特征。样品采集时间为2015年7月1日至7月15日，包含草甸，草原，荒漠3种生态系统。土壤样品用冰袋保存，运回北京青藏高原研究所生态实验室。土壤DNA通过MO BIO PowerSoil DNA试剂盒提取。土壤表层样品采集后用液氮保存，运回悉尼实验室，通过FastPrep DNA试剂盒提取。提取后的DNA样品使用515F (5'-GTGCCAGCMGCCGCGGTAA-3') and 909r (5'-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3')扩增16S rRNA基因片段。扩增后的片段通过Illumina Miseq PE250方式测序，原始数据通过Mothur软件分析。首先去除测序质量不佳序列，之后进行排序并去除嵌合体序列。之后计算序列之间相似度，相似度在97%以上的序列聚类为一个OTU，并定义OTU代表序列。OTU代表序列通过与Silva数据库进行比对，在可靠性大于>80%的情况下鉴定到属一级水平。本数据系统的比较了青藏高原微生物的多样性，对研究微生物在青藏高原的分布具有重大意义。
提供机构：
国家青藏高原科学数据中心
创建时间：
2021-04-07
