Pleural-Line-Segmentation-Masks
收藏资源简介:
该数据集名为Pleural-Line Masks with Stanford LUS Frames,是一个用于医学图像分析的开源数据集,主要支持图像分割和视频分类任务。其核心内容包括胸膜线掩膜及对应的肺部超声图像帧,旨在推动解剖引导的肺部超声视频分类研究。掩膜数据通过两种方式生成:一是由四位人类标注者利用sam2模型进行点提示标注并通过视频聚合得到;二是由U-Net模型预测生成,并经过人工审查和验证。超声图像帧源自公开的Stanford LUS数据集,以预提取的帧形式提供,确保了帧与掩膜的正确配对,简化了数据处理。数据集按患者和扫描区域组织,每个患者-区域目录对应一个视频序列,包含图像帧文件和掩膜文件。关键元数据文件包括:`split.csv`定义患者级别的交叉验证划分,确保同一患者的所有视频位于同一折叠;`data_patient_zone_with_labels.csv`记录每个患者-区域视频的唯一标识符、视频级分类标签(0:健康,1:B线,2:实变,3:B线和实变)及帧目录路径;`masks_info.csv`索引所有可用的胸膜线掩膜,包括有效性标志、文件路径和来源标注者(-1表示U-Net预测后验证,0-3表示人类标注者)。该数据集适用于胸膜线自动分割、基于解剖先验的超声视频分类模型开发、注意力机制监督等研究场景,支持实验复现,但仅用于研究,不应用于临床诊断。
The dataset is named Pleural-Line Masks with Stanford LUS Frames and is an open-source dataset for medical image analysis, primarily supporting image segmentation and video classification tasks. Its core content consists of pleural line masks and corresponding lung ultrasound image frames, aiming to promote anatomically-guided lung ultrasound video classification research. Mask data is generated in two ways: first, by four human annotators using the sam2 model for point-prompt annotation and aggregated via video; second, by U-Net model predictions, followed by manual review and validation. Ultrasound image frames are sourced from the public Stanford LUS dataset, provided as pre-extracted frames to ensure correct pairing with masks and simplify data processing. The dataset is organized by patient and scan zone, with each patient-zone directory corresponding to a video sequence containing image frame files and mask files. Key metadata files include: `split.csv` defines patient-level cross-validation splits, ensuring all videos from the same patient are in the same fold; `data_patient_zone_with_labels.csv` records unique identifiers, video-level classification labels (0: healthy, 1: B-lines, 2: consolidation, 3: B-lines and consolidation), and frame directory paths for each patient-zone video; `masks_info.csv` indexes all available pleural line masks, including validity flags, file paths, and source annotators (-1 for U-Net predictions after validation, 0-3 for human annotators). This dataset is suitable for research scenarios such as automatic pleural line segmentation, development of ultrasound video classification models based on anatomical priors, and supervision of attention mechanisms, supporting full experimental reproducibility, but is intended for research only and not for direct clinical diagnosis.
数据集概述:Pleural-Line Masks with Stanford LUS Frames
基本信息
- 数据集名称:Pleural-Line Masks with Stanford LUS Frames
- 语言:英语
- 任务类别:图像分割、视频分类
- 标签:医学影像、超声、肺部超声、胸膜线
- 许可证:其他(非标准)
数据集内容
该数据集包含胸膜线掩膜及其对应的肺部超声帧,用于解剖引导的视频分类。掩膜集包括:
- 由四位人类标注者通过 SAM2 模型点提示和视频聚合创建的掩膜
- 由 U-Net 预测并经审核验证的掩膜
- 可复现训练流程所需的元数据
超声帧来源于开放的 Stanford LUS 数据集,以预提取帧的形式提供,以保留帧-掩膜配对关系,并避免重复视频预处理。
目录结构
每个患者-区域目录代表一个视频。帧直接存储在区域目录中,掩膜存储在 masks/masks 下。
<dataset_root>/ ├── <patient_id>/ │ └── <zone_id>/ │ ├── <frame files> │ └── masks/ │ └── <mask files> ├── split.csv ├── data_patient_zone_with_labels.csv └── masks_info.csv
并非每一帧都有有效掩膜,无掩膜的帧仍作为视频序列的一部分使用。
元数据文件
split.csv
定义患者级别的交叉验证折。
| 列名 | 描述 |
|---|---|
patientid |
患者标识符 |
split |
交叉验证折 |
同一患者的所有视频保持在同一个折中。
data_patient_zone_with_labels.csv
每个患者-区域视频对应一行。
| 列名 | 描述 |
|---|---|
Patient_Zone_ID |
患者-区域视频的唯一标识符 |
label |
视频级别的分类标签 |
frames_path |
相对于数据集根的帧目录路径 |
分类标签包括:
| 标签 | 类别 |
|---|---|
0 |
健康 |
1 |
B线 |
2 |
实变 |
3 |
B线和实变 |
masks_info.csv
索引可用的胸膜线掩膜。
| 列名 | 描述 |
|---|---|
patient_zone_id |
对应 Patient_Zone_ID 的患者-区域标识符 |
valid |
掩膜是否通过验证并可使用 |
mask_path |
掩膜图像的路径 |
annotator |
掩膜来源 |
标注者取值含义:
| 值 | 含义 |
|---|---|
-1 |
由 U-Net 预测,经审核验证 |
0-3 |
人类标注者 0-3 |
仅 valid 值为有效的掩膜应用于掩膜监督训练。
预期用途
该数据集旨在用于以下研究:
- 胸膜线分割
- 解剖引导的肺部超声分类
- 注意力监督
- 附带实验的可复现性
不适用于直接临床诊断或未经独立验证和监管审查的部署。
数据来源
超声帧来自 Stanford LUS 数据集,为方便复现而包含。原始数据集条款仍然适用。胸膜线掩膜及相关元数据是为附属研究项目创建的。
参考文献
- 论文:https://arxiv.org/abs/2607.17551
- 代码:https://github.com/Alya-Almsouti/LUS-video-classification





