Supplementary files of "TMT-based quantitative proteome data of MSP1 overexpressed rice"
收藏Mendeley Data2024-03-27 更新2024-06-26 收录
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Supplementary files related to the data article "TMT-based quantitative proteome data of MSP1 overexpressed rice" C.W. Min, J.W. Jang, G.H. Lee, G. Ravi, S.T. Kim. Data in Brief (2022). This article reporting potential PRR candidates which may function as receptor for recognition of MSP1 in rice. This data complements the original research article published in Journal of Proteomics: C.W. Min, J.W. Jang, G.H. Lee, R. Gupta, H.J. Park, H.S. Cho, S.R. Park, S. Kwon, L. Cho, K. Jung, Y. Kim, Y. Wang, S.T. Kim, TMT-based quantitative membrane proteomics identified PRRs potentially involved in the perception of MSP1 in rice leaves, J. Proteomics 267 (2022) 104687, https://doi.org/10.1016/j.jprot.2022.104687. Supplementary table legends Supplementary Table 1. List of primers used in this study. Supplementary Table 2. Identification of significantly modulated proteins in the rice leaves by TMT-based quantitative proteomic analysis. Supplementary Table 3. MapMan analysis of whole differential proteins. Supplementary Table 4. Functional characterization of proteins related to RLK, MAPK, calcium signaling, hormone signaling, and stress & redox using MapMan analysis.
本数据集为与数据论文《基于串联质谱标签(Tandem Mass Tag, TMT)的MSP1过表达水稻定量蛋白质组数据》相关的补充文件,该论文作者为C.W. Min、J.W. Jang、G.H. Lee、G. Ravi、S.T. Kim,发表于《Data in Brief》(2022年)。该论文报道了潜在的模式识别受体(Pattern Recognition Receptor, PRR)候选蛋白,其可在水稻中作为识别MSP1的受体发挥功能。本数据集补充了发表于《Journal of Proteomics》的原创研究论文,该论文由C.W. Min、J.W. Jang、G.H. Lee、R. Gupta、H.J. Park、H.S. Cho、S.R. Park、S. Kwon、L. Cho、K. Jung、Y. Kim、Y. Wang、S.T. Kim 撰写,题为《基于TMT的定量膜蛋白质组学鉴定水稻叶片中潜在参与MSP1识别的PRRs》,发表于*J. Proteomics* 267 (2022) 104687,DOI链接:https://doi.org/10.1016/j.jprot.2022.104687。补充表格注释如下:
补充表1:本研究使用的引物列表
补充表2:基于TMT定量蛋白质组学分析鉴定的水稻叶片中显著差异调控蛋白
补充表3:全部差异蛋白的MapMan分析结果
补充表4:通过MapMan分析对类受体激酶(Receptor-like kinase, RLK)、丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-activated protein kinase, MAPK)、钙信号通路、激素信号通路及应激与氧化还原相关蛋白进行的功能表征。
创建时间:
2024-01-23
搜集汇总
背景与挑战
背景概述
该数据集是'MSP1过表达水稻的TMT定量蛋白质组数据'的补充文件,关联于一篇Data in Brief文章,报道了潜在的模式识别受体(PRR)候选物,可能在水稻中识别MSP1。数据包括四个补充表格,涵盖引物列表、显著调节蛋白质的鉴定、差异蛋白质的MapMan分析,以及涉及信号通路和应激响应的蛋白质功能表征,旨在支持原始研究中对MSP1感知机制的探索。
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