五个Laburnicola rhizohalophila菌株转录组结果

为了研究二倍体的形成是否与转录变化有关，我们使用RNA-seq数据分析了这两种二倍体和三种单倍体的表达谱。设置了4种真菌生长条件，包括3种盐胁迫梯度(0 M NaCl、0.3 M NaCl和0.8 M NaCl)和与植物共生，已知这些条件可诱导不同的表型和基因表达变异。在体外实验中，真菌菌落在24℃覆盖玻璃纸膜的PDA培养基上生长2周。将生长在每个平板上的菌丝体从玻璃纸上轻轻刮下来，收集起来，在液氮中快速冷冻，保存在-80°C，以待进一步分析。在植物试验中，真菌转录物在受感染的根中进行了研究。共培养三周后，定植的根用于RNA提取。每种生长条件使用3个独立的生物重复，得到60个文库。